Après avoir subjugué les démons de la vallée de Bumdeling, Guru Rimpoché avait prédit qu'un temple et un chorten seraient édifiés à cet endroit, au milieu des rizières.

Selon la tradition, Chorten Kora aurait été fondé au 17° siècle par un bhoutanais qui en aurait rapporté le modèle du Népal, sculpté dans un radis.