Endommagé de nombreuses fois par des incendies, inondations et tremblements de terre, le dzong de Punakha - Punthang Dechen Phodrang - qui se dresse au confluent des rivières Pho et Mo, a été rebâti de nombreuses fois au cours des siècles. En 1981, un grand chorten a été construit dans la première cour, tandis que la deuxième cour a presque intégralement été détruite par une inondation en 1994. L'actuelle Kunrey, salle de congrégation, date de 2003.